Атероми лікують єдиним методом – видаленням. У випадку з тріходермальною кістою щелепно-лицьової ділянки найбільш доцільним буде хірургічне видалення. Під час цього маленького оперативного втручання лікар робить мікророзтин шкіри, видаляє капсулу й накладає шов. Якщо ж вміст атероми вже розлився на сусідні тканини, проводиться їх очищення, застосовуються антисептичні та протимікробні засоби. Після цього накладається косметичний шов. Процес видалення нагадує лікування абсцесу та іноді потребує накладення дренажів.
Існують ще два способи видалення атероми: лазерний та радіохвильовий, але їх не рекомендується застосовувати для зони обличчя та щелепи.